Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmbsP22907 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmbsP22907 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms