Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk1P22518 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk1P22518 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk1P22518 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms