Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcer1aP20489 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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