Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TP20293 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TP20293 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TP20293 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TP20293 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TP20293 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TP20293 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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