Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18532 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18532 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18532 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18532 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18532 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18532 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18532 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18532 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18532 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18532 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms