Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PcnaP17918 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms