Protein–RNA interactions for Protein: P15209

Ntrk2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntrk2P15209 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ntrk2P15209 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ntrk2P15209 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms