Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms