Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtcP11725 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtcP11725 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
OtcP11725 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
OtcP11725 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
OtcP11725 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
OtcP11725 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
OtcP11725 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
OtcP11725 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
OtcP11725 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
OtcP11725 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
OtcP11725 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
OtcP11725 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
OtcP11725 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
OtcP11725 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
OtcP11725 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
OtcP11725 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
OtcP11725 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
OtcP11725 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms