Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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