Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms