Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb7P09024 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb7P09024 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb7P09024 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb7P09024 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb7P09024 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb7P09024 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb7P09024 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb7P09024 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb7P09024 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms