Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hoxa5P09021 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa5P09021 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms