Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa4P06728 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa4P06728 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa4P06728 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa4P06728 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa4P06728 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa4P06728 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa4P06728 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa4P06728 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa4P06728 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa4P06728 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa4P06728 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoa4P06728 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoa4P06728 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoa4P06728 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoa4P06728 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoa4P06728 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms