Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc4a1P04919 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc4a1P04919 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc4a1P04919 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc4a1P04919 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc4a1P04919 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc4a1P04919 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc4a1P04919 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc4a1P04919 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc4a1P04919 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc4a1P04919 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc4a1P04919 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc4a1P04919 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc4a1P04919 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc4a1P04919 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc4a1P04919 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc4a1P04919 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc4a1P04919 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a1P04919 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms