Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms