Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01678 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01678 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01678 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01678 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01678 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01678 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01678 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01678 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01678 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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