Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ShdO88834 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ShdO88834 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ShdO88834 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ShdO88834 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms