Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClppO88696 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClppO88696 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClppO88696 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClppO88696 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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