Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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CntfrO88507 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CntfrO88507 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CntfrO88507 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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