Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Kcnk4O88454 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Kcnk4O88454 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Kcnk4O88454 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Kcnk4O88454 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Kcnk4O88454 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Kcnk4O88454 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Kcnk4O88454 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Kcnk4O88454 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Kcnk4O88454 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Kcnk4O88454 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk4O88454 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms