Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnt1O88346 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnt1O88346 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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