Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid2O88322 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nid2O88322 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nid2O88322 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nid2O88322 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nid2O88322 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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