Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna4O70174 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrna4O70174 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms