Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ldb2O55203 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ldb2O55203 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Ldb2O55203 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ldb2O55203 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ldb2O55203 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ldb2O55203 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ldb2O55203 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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