Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aff2O55112 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aff2O55112 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aff2O55112 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aff2O55112 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aff2O55112 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aff2O55112 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aff2O55112 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aff2O55112 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aff2O55112 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aff2O55112 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aff2O55112 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aff2O55112 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aff2O55112 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aff2O55112 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aff2O55112 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aff2O55112 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Aff2O55112 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Aff2O55112 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Aff2O55112 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aff2O55112 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms