Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms