Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms