Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lgals6O54891 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lgals6O54891 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lgals6O54891 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lgals6O54891 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lgals6O54891 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lgals6O54891 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lgals6O54891 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lgals6O54891 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lgals6O54891 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lgals6O54891 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lgals6O54891 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lgals6O54891 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lgals6O54891 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lgals6O54891 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lgals6O54891 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lgals6O54891 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lgals6O54891 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms