Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms