Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbrO54799 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NmbrO54799 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbrO54799 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms