Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DffbO54788 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
DffbO54788 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffbO54788 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffbO54788 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffbO54788 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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