Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Sdc4O35988 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sdc4O35988 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sdc4O35988 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sdc4O35988 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sdc4O35988 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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