Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rab33bO35963 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rab33bO35963 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rab33bO35963 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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