Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Sp100O35892 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Sp100O35892 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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