Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms