Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc27a2O35488 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms