Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TnxbO35452 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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TnxbO35452 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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TnxbO35452 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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TnxbO35452 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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TnxbO35452 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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TnxbO35452 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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TnxbO35452 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TnxbO35452 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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TnxbO35452 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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TnxbO35452 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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TnxbO35452 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TnxbO35452 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TnxbO35452 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms