Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2f3O35261 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2f3O35261 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2f3O35261 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f3O35261 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f3O35261 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f3O35261 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f3O35261 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f3O35261 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f3O35261 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f3O35261 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f3O35261 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f3O35261 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f3O35261 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms