Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms