Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms