Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kif1cO35071 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Kif1cO35071 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kif1cO35071 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kif1cO35071 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kif1cO35071 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif1cO35071 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kif1cO35071 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif1cO35071 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms