Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcm2O09102 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcm2O09102 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms