Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NumblO08919 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NumblO08919 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NumblO08919 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NumblO08919 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NumblO08919 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NumblO08919 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NumblO08919 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NumblO08919 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms