Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3aO08665 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms