Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna5O08543 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms