Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2888K7N746 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2888K7N746 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms