Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3542K7N6U2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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