Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms