Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms